Do khan hiếm các ghi chép có liên quan đến Shepseskare, nên không thể khẳng định chắc chắn về mối quan hệ của ông với các vị tiên vương. Ông có thể đã là một thành viên của hoàng tộc[35][47], mặc dù khả năng ông là một kẻ tiếm vị không có liên quan đến các vị vua tiền triều vẫn chưa được loại bỏ một cách hoàn toàn.[48]

Silke Roth đã đề xuất rằng Shepseskare là một người con trai của vua Neferirkare Kakai và là một người anh en của cả Neferefre và Nyuserre Ini[49]. Tuy nhiên, Verner lại cho rằng Shepseskare là con trai của Sahure, ông ta đã cướp ngôi trong một khoảng thời gian ngắn sau khi Neferefre qua đời một cách đột ngột[40]. Điều này sẽ giải thích cho lý do tại sao kim tự tháp dang dở của Shepseskare lại nằm gần với kim tự tháp của Sahure. Giả thuyết này ngày càng nhận được nhiều sự đồng thuận sau khi Verner và Tarek El Awady phát hiện ra bức phù điêu từ con đường đắp thuộc khu phức hợp kim tự tháp của Sahure vào năm 2005, trong đó miêu tả nhà vua cùng với nữ hoàng Meretnebty và hai người con trai của họ là Ranefer và Netjerirenre[50]. Cả hai người con trai đều mang tước hiệu của "người con trai cả của đức vua", điều này cho thấy rằng họ có thể là một cặp song sinh. Bức phù điêu này còn cho chúng ta biết rằng Ranefer đã lên ngôi và trở thành "Neferirkare vua của Thượng và Hạ Ai Cập".[50]Nhờ vậy, Verner và Awady đã suy đoán rằng trong khi Ranefer và người con trai Neferefre của ông ta đã trở thành các vị vua, thì Netjerirenre có thể đã cố gắng chiếm đoạt ngai vàng sau khi người cháu của ông ta qua đời. Theo giả thuyết này, Shepseskare sẽ là tên gọi của Netjerirenre sau khi lên ngôi[51]. Tuy vậy, ngay bản thân Verner cũng đã viết vào năm 1997 rằng Shepseskare có thể là con của Shepseskaf, vị pharaon cuối cùng của vương triều thứ tư hoặc Userkaf hoặc Neferirkare Kakai giống như Roth đã gợi ý: bởi vì hiện nay có rất ít chứng cứ liên quan đến vấn đề này và tất cả các khả năng chỉ là suy đoán.[52]

Triều đại của Shepseskare đã kết thúc nhanh chóng có lẽ là do ông đã qua đời một cách đột ngột hoặc có thể ông đã bị Nyuserre Ini lật đổ, vị vua này là em trai của Neferefre và là một người con trai khác của vua Neferirkare với nữ hoàng Khentkaus II. Vai trò then chốt của nữ hoàng Khentkaus II trong việc giúp vua Nyuserre lên ngôi có thể giải thích cho lý do tại sao bà lại nhận được nhiều sự kính mến trong nền văn học dân gian Ai Cập cũng như việc vua Nyuserre đã tiến hành "mở rộng thêm và nâng cấp ngôi đền tang lễ của bà"[53]. Nyuserre dường như cũng đã nhận được sự ủng hộ từ những viên cận thần và quan lại đầy quyền lực, mà trước hết là Ptahshepses, người sẽ trở thành con rể của Nyuserre và là tể tướng của ông ta.[54]